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O percurso "Margem Esquerda" permite aos visitantes tomar contacto com espaços diversificados e de elevado valor natural, que passam por matas, relíquias do ecossistema florestal-carvalhal, bosques ribeirinhos, jardins românticos e áreas húmidas de paul, onde a flora e fauna variam em função das características ecológicas de cada um dos locais, permitindo ao visitante o contacto com algumas das espécies (flora e fauna) mais representativas do nosso património natural.
Na envolvente da Escola Superior Vasco da Gama existe uma mata de elevado valor natural. Possui zonas de vegetação ainda com a composição da floresta primitiva, progredindo da vegetação ribeirinha para um carvalhal. As nascentes de água, em conjugação com o ambiente húmido das vertentes expostas a Norte, possibilitaram o estabelecimento de uma diversificada comunidade de anfíbios. Outros grupos de fauna estão igualmente bem representados, salientando-se as aves, pela maior facilidade de observação.
O Jardim da Quinta das Lágrimas, para além do reconhecido valor histórico e cultural, apresenta uma grande variedade de espécies de árvores, muitas das quais exóticas, provenientes de alguns jardins botânicos, que se associam em beleza e porte ao esplendor de todo o espaço da Quinta.
A Reserva Natural do Paúl de Arzila é uma zona húmida, das mais importantes a nível nacional, detentora de uma riquíssima diversidade biológica, sendo disso prova os estatutos de protecção que lhe foram atribuídos. Durante o Inverno acolhe diversas espécies de anatídeos migradores, que utilizam esta área para descanso e alimentação. Gerido pelo Instituto de Conservação da Natureza, encontra-se infra-estruturado para dar apoio aos visitantes.
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